Program Studi Pendidikan Luar Biasa (PLB) berada pada naungan FKIP UPY, secara resmi diselenggarakan berdasarkan SK Menteri Riset, Teknologi danPendidikan Tinggi nomor: 560/KPT/I/2017 tertanggal 2 Oktober 2017. Program Studi PLB UPY mulai melakukan kegiatan pada tanggal 2 Oktober 2018 dengan membuka pendaftaran kepada calon mahasiswa lulusan SMA atau sederajat yang memiliki minat mengembangkan kemampuan dan keilmuan Pendidikan Luar Biasa dalam Program Studi PLB FKIP UPY.
Prodi PLB FKIP UPY merupakan salah satu Program Studi yang menyelenggarakan Program Sarjana Pendidikan Luar Biasa dari 18 Prodi PLB di seluruh Indonesia. Saat ini terdapat 2 Program Studi Pendidikan Luar Biasa yang berlokasi di Daerah Istimewa Yogyakarta. Proporsi Sekolah Luar Biasa di Indonesia menunjukan jumlah 2246 Sekolah dengan proporsi Sekolah Luar Biasa Negeri 592 Sekolah sedangkan Sekolah Luar Biasa Swasta 1654 sekolah, melihat dari banyaknya jumlah Sekolah Luar Biasa yang ada di Indonesia dan melihat jumlah Universitas Penyelenggara Program Studi Pendidikan Luar Biasa yang berjumlah 18, maka Program Studi Pendidikan Luar Biasa memiliki peluang yang besar dalam keterserapan calon pendidik luar biasa.
Program Studi Pendidikan Luar Biasa merupakan salah satu program studi baru di lingkungan Universitas PGRI Yogyakarta. Visi dari Program Studi Pendidikan Luar Biasa adalah “Pada tahun 2043 PLB FKIP UPY menjadi program studi unggul, menghasilkan sarjana pendidikan luar biasa yang SIGAP (Santun, Inklusif, Berwawasan Glokal, Adaptif, dan Profesional). Sedangkan Misi Program Studi Pendidikan Luar Biasa FKIP UPY, yaitu 1) Mengembangkan tata kelola program studi yang efektif, efisien, demokratis, transparan, dan akuntabel serta berdaya saing tinggi; 2) Menyelenggarakan kegiatan pendidikan akademik yang berkualitas berbasis pada teknologi dan berpusat pada mahasiswa untuk menghasilkan lulusan yang SIGAP (Santun, Inklusif, Berwawasan Glokal, Adaptif, dan Profesional); 3) Menyelenggarakan penelitian yang inovatif, kolaboratif, dan inklusif untuk mengembangkan kelilmuan pendidikan luar biasa dan; 4) Menyelenggarakan kegiatan pengabdian masyarakat yang inklusif, inovatif, dan kolaboratif. Tujuan Program Studi Pendidikan Luar Biasa adalah 1) Tata kelola program studi yang efektif, efesien, kridebel, transparan, akuntabel, adil, dan bertanggungjawab serta berdaya saing; 2). Lulusan yang berkualitas dengan menghasilkan sarjana pendidikan yang SIGAP (Santun, Inklusif, Berwawasan Glokal, Adaptif, dan professional); 3). Produk penelitian dalam bidang pendidikan luar biasa yang dapat mengembangkan ilmu pengetahuan, teknologi dan seni khususnya bagi penyandang disabilitas; 4) Produk Pengabdian Masyarakat dalam bidang pendidikan khusus yang dapat mewujudkan kesejahteraan masyarakat, bangsa, negara dan umat manusia khususnya bagi penyandang disabilitas; 5). Kerjasama yang dapat mendukung pengembangan pendidikan, penelitian dan pengabdian masyarakat secara berkelanjutan.